Николай Ханенко был двоюродным внуком гетмана Михаила Ханенко и сыном полковника Даниила Ханенко.

Согласно данным «Википедии», родился в Лохвице. Учился в Киевской Академии, затем в Львове. С 1710-го на военной службе, с 1717-го военный, 1721 г. — старший военный канцелярист (помощник генерального писаря), доверенное лицо гетманов Ивана Скоропадского и Павла Полуботка.

В мае 1723-го Павел Полуботок выслал Ханенко в составе депутации («от всего малороссийского народа») до Петербурга добиваться разрешения на избрание гетмана; здесь Ханенко вместе с Полуботком был заключен в Петропавловскую крепость. В 1726 году Ханенко вернулся в Украину и был назначен судьей Стародубского полка (1727-1738), впоследствии стародубским полковым обозным. 1735 — 1739 принимал участие в русско-турецкой войне в Крыму как наказной стародубский полководец.

За военные заслуги 1738  г. назначен генеральным бунчужным, 1740 г. – член Генерального Суда, а с 1741-го – генеральным хорунжим и был им до конца жизни, которая оборвалась в 1760 году.